MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 37452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010278	AATGA	2	10	28936	28945	60 %	20 %	20 %	0 %	165975483
502	NC_010278	GAA	2	6	28965	28970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975483
503	NC_010278	GCT	2	6	29031	29036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975483
504	NC_010278	GAA	2	6	29098	29103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975483
505	NC_010278	TA	3	6	29201	29206	50 %	50 %	0 %	0 %	165975483
506	NC_010278	AGA	2	6	29223	29228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975483
507	NC_010278	TTCAGG	2	12	29288	29299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975483
508	NC_010278	GTGA	2	8	29314	29321	25 %	25 %	50 %	0 %	165975483
509	NC_010278	TGG	2	6	29471	29476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975483
510	NC_010278	GAA	2	6	29491	29496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975483
511	NC_010278	TCA	2	6	29523	29528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975483
512	NC_010278	GCTG	2	8	29541	29548	0 %	25 %	50 %	25 %	165975483
513	NC_010278	A	6	6	29581	29586	100 %	0 %	0 %	0 %	165975483
514	NC_010278	ATG	2	6	29660	29665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975483
515	NC_010278	TGT	2	6	29694	29699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975483
516	NC_010278	AATTT	2	10	29702	29711	40 %	60 %	0 %	0 %	165975483
517	NC_010278	CGG	2	6	29760	29765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975483
518	NC_010278	AAAT	2	8	29808	29815	75 %	25 %	0 %	0 %	165975483
519	NC_010278	ATT	2	6	29830	29835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975483
520	NC_010278	TGA	2	6	29838	29843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975483
521	NC_010278	AAT	2	6	29995	30000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975483
522	NC_010278	TTA	2	6	30022	30027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975483
523	NC_010278	ATT	2	6	30060	30065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975483
524	NC_010278	TGCT	2	8	30092	30099	0 %	50 %	25 %	25 %	165975483
525	NC_010278	AAAC	2	8	30276	30283	75 %	0 %	0 %	25 %	165975484
526	NC_010278	TCAA	2	8	30317	30324	50 %	25 %	0 %	25 %	165975484
527	NC_010278	ATTG	2	8	30372	30379	25 %	50 %	25 %	0 %	165975484
528	NC_010278	TAA	2	6	30382	30387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975484
529	NC_010278	AAT	2	6	30464	30469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975484
530	NC_010278	TTA	2	6	30596	30601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975484
531	NC_010278	CGGT	2	8	30633	30640	0 %	25 %	50 %	25 %	165975484
532	NC_010278	T	6	6	30685	30690	0 %	100 %	0 %	0 %	165975484
533	NC_010278	T	6	6	30893	30898	0 %	100 %	0 %	0 %	165975484
534	NC_010278	ATCGG	2	10	30935	30944	20 %	20 %	40 %	20 %	165975484
535	NC_010278	TGC	2	6	30971	30976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975484
536	NC_010278	GCAA	2	8	30983	30990	50 %	0 %	25 %	25 %	165975484
537	NC_010278	CTG	2	6	30996	31001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975484
538	NC_010278	TAA	2	6	31012	31017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975484
539	NC_010278	T	6	6	31024	31029	0 %	100 %	0 %	0 %	165975484
540	NC_010278	CGC	2	6	31044	31049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975484
541	NC_010278	CGTG	2	8	31074	31081	0 %	25 %	50 %	25 %	165975484
542	NC_010278	TTG	2	6	31099	31104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975484
543	NC_010278	CCG	2	6	31193	31198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975484
544	NC_010278	AAG	2	6	31218	31223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975484
545	NC_010278	CCG	2	6	31238	31243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975484
546	NC_010278	T	6	6	31300	31305	0 %	100 %	0 %	0 %	165975484
547	NC_010278	T	6	6	31313	31318	0 %	100 %	0 %	0 %	165975484
548	NC_010278	T	6	6	31333	31338	0 %	100 %	0 %	0 %	165975484
549	NC_010278	CAA	2	6	31341	31346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975484
550	NC_010278	ACG	2	6	31399	31404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975484
551	NC_010278	GCTT	2	8	31495	31502	0 %	50 %	25 %	25 %	165975484
552	NC_010278	TAAACT	2	12	31597	31608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	165975484
553	NC_010278	ATT	2	6	31676	31681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975484
554	NC_010278	TAG	2	6	31765	31770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975485
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556	NC_010278	TCA	2	6	31787	31792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975485
557	NC_010278	CTG	2	6	31805	31810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975485
558	NC_010278	AAG	2	6	31896	31901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975485
559	NC_010278	CCCATT	2	12	31948	31959	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	165975485
560	NC_010278	CCAC	2	8	32030	32037	25 %	0 %	0 %	75 %	165975485
561	NC_010278	AAT	3	9	32107	32115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975485
562	NC_010278	CCG	2	6	32170	32175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975485
563	NC_010278	AGC	2	6	32200	32205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975485
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565	NC_010278	GAT	2	6	32297	32302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975485
566	NC_010278	AGCA	2	8	32334	32341	50 %	0 %	25 %	25 %	165975485
567	NC_010278	T	6	6	32435	32440	0 %	100 %	0 %	0 %	165975485
568	NC_010278	CA	3	6	32524	32529	50 %	0 %	0 %	50 %	165975486
569	NC_010278	GA	3	6	32561	32566	50 %	0 %	50 %	0 %	165975486
570	NC_010278	ATC	2	6	32577	32582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975486
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572	NC_010278	CCG	2	6	32901	32906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975486
573	NC_010278	GCAG	2	8	32907	32914	25 %	0 %	50 %	25 %	165975486
574	NC_010278	ATA	2	6	32958	32963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975486
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578	NC_010278	CCGA	2	8	33354	33361	25 %	0 %	25 %	50 %	165975486
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581	NC_010278	TCT	2	6	33533	33538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975487
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583	NC_010278	AAT	2	6	33611	33616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975487
584	NC_010278	TCA	2	6	33624	33629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975487
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589	NC_010278	TTTG	2	8	34051	34058	0 %	75 %	25 %	0 %	165975487
590	NC_010278	CCG	2	6	34132	34137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975487
591	NC_010278	CATC	2	8	34240	34247	25 %	25 %	0 %	50 %	165975487
592	NC_010278	TAAAT	2	10	34331	34340	60 %	40 %	0 %	0 %	165975487
593	NC_010278	GCT	2	6	34391	34396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975487
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598	NC_010278	T	7	7	34530	34536	0 %	100 %	0 %	0 %	165975487
599	NC_010278	TGG	2	6	34564	34569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975487
600	NC_010278	A	6	6	34581	34586	100 %	0 %	0 %	0 %	165975487
601	NC_010278	ACGA	2	8	34599	34606	50 %	0 %	25 %	25 %	165975487
602	NC_010278	TAA	2	6	34694	34699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975487
603	NC_010278	T	6	6	34959	34964	0 %	100 %	0 %	0 %	165975487
604	NC_010278	CTTT	2	8	34980	34987	0 %	75 %	0 %	25 %	165975487
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608	NC_010278	AAG	2	6	35293	35298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975488
609	NC_010278	TAAGT	2	10	35356	35365	40 %	40 %	20 %	0 %	165975488
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611	NC_010278	TTC	2	6	35412	35417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975488
612	NC_010278	TTC	2	6	35422	35427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975488
613	NC_010278	ACC	2	6	35515	35520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165975488
614	NC_010278	ACCG	2	8	35538	35545	25 %	0 %	25 %	50 %	165975488
615	NC_010278	ACGG	2	8	35573	35580	25 %	0 %	50 %	25 %	165975488
616	NC_010278	CTT	2	6	35597	35602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975488
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619	NC_010278	ATA	2	6	35770	35775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975488
620	NC_010278	CTT	2	6	35789	35794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975488
621	NC_010278	TACG	2	8	35858	35865	25 %	25 %	25 %	25 %	165975488
622	NC_010278	AAC	2	6	35901	35906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975488
623	NC_010278	CGTA	2	8	36000	36007	25 %	25 %	25 %	25 %	165975488
624	NC_010278	GAA	2	6	36096	36101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975488
625	NC_010278	TTC	2	6	36174	36179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975488
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